Нові системні плати часто мають нові функції або стандарти, які можуть бути несумісні зі старішими компонентами. Вибираючи системну плату на заміну, перевірте, чи підтримує вона вже встановлені ЦП, ОЗП, відеоадаптер та інші плати адаптерів. Процесорний роз'єм і чіпсет системної плати мають бути сумісними з ЦП. Системна плата також має бути сумісна з існуючим радіатором і вентилятором, якщо використовується старий ЦП. Зверніть особливу увагу на кількість і тип гнізд розширення. Перевірте, чи відповідають вони вже існуючим платам адаптерів і чи допускають використання нових плат. Існуючий блок живлення повинен мати роз'єми, що відповідають новій системній платі. І, нарешті, нова системна плата повинна фізично поміщатися в уже існуючий корпус комп'ютера.
На різних системних платах використовуються різні набори мікросхем системної логіки. Чіпсет складається з інтегральних мікросхем, що управляють взаємодією ЦП та інших компонентів. Набір мікросхем системної логіки визначає, скільки пам'яті можна додати до системної плати, і тип роз'ємів системної плати. Складаючи комп'ютер, вибирайте набір мікросхем системної логіки, що відповідає вашим потребам. Наприклад, можна придбати системну плату з чіпсетом, який дозволяє використати декілька портів USB, роз'єми eSATA, об'ємний звук і відео.
Системні плати мають різні типи гнізд і роз'ємів для ЦП. Роз’єм або гніздо − це точка підключення й електричний інтерфейс для ЦП. Корпус ЦП повинен відповідати типу роз'єму або гнізда системної плати. У корпус ЦП входять власне мікросхема ЦП, точки підключення та матеріали, що оточують ЦП і розсіюють тепло.
Дані передаються з однієї частини комп'ютера до іншої через набір дротів, відомий як шина. Шина складається з двох частин. Частина шини, що відповідає за дані, це шина даних. По ній дані передаються між компонентами комп'ютера. Частина, що відповідає за адресацію, називається шиною адреси. По ній передаються адреси місць розташування пам'яті, по яких ЦП може прочитати або записати дані.
Від розміру шини залежить кількість даних, що передаються одноразово. По 32-розрядній шині одночасно передаються 32 біта даних з процесора в ОЗП або в інші компоненти системної плати. По 64-розрядній шині одночасно передаються 64 біта даних. Швидкість, з якою дані передаються через шину, визначається тактовою частотою, яка вимірюється в мегагерцах або гігагерцах.
Гнізда розширення PCI, сполучені з паралельною шиною, яка відправляє декілька біт даних по множині дротів одночасно. Гнізда розширення PCI нині замінюються гніздами розширення PCIe, що підключаються до послідовної шини, по якій передається одночасно один біт з більш вищою швидкістю. Складаючи комп'ютер, слід вибирати системну плату, яка має гнізда, що відповідають поточним і прогнозованим потребам користувача. Наприклад, складаючи комп'ютер для ігор, що вимагають наявності двох відеокарт, слід вибрати системну плату з двома гніздами PCIe x16.